Uma série de terremotos atinge o Japão e desenterra um misterioso ovo na Infant Island. Quando três pesquisadores são enviados para a ilha, eles descobrem fadas gêmeas que os advertem a não perturbarem o ovo – o ovo de Mothra. Quando eles tomam o ovo da ilha, o ovo se choca, Godzilla desperta e a batalha pela Terra começa.